美国临床微生物学专家指出，如果冲水时马桶盖打开，马桶内的瞬间气旋最高可以将病菌或微生物带到6米高的空中，并悬浮在空气中长达几小时，进而落在墙壁和物品上。现在大部分家庭中，如厕、洗漱、淋浴都在卫生间里进行，牙刷、漱口杯、毛巾等与马桶共处一室，自然很容易受到细菌污染，并通过它们进入口腔和呼吸道。因此，应养成冲水时盖上马桶盖的习惯。
　　
　　复旦大学公共卫生学院专门研究卫生微生物学的郁庆福教授指出，调查发现，32％的马桶上有痢疾杆菌，其中一种名为“宋内”的痢疾杆菌在马桶圈上存活的时间长达17天；不少人冬天喜欢在马桶上套个绒布垫圈，这样更容易吸附、滞留排泄污染物，传播疾病的可能性更大。布制的垫圈最好不用，如果一定要使用的话，应经常清洗消毒。
　　
　　大多数家庭都会在马桶边设一个废纸篓，存放使用过的厕纸，但这样会造成细菌随空气散播。应该将厕纸丢进马桶内冲走。有时可以备一个卫生袋，没必要再设废纸篓。如果一定要用，也要选带盖子的，并及时处理用过的厕纸。