在中国两年，李佳怡的努力还是很有成效的。中国市场的战略转型比较成功，新引入了CoverGirl（封面女郎）和illume（伊奈美）。如果没有遭遇SK-II的信任危机的话，可以说是一个完美的两年。
2006年9月14日，国家质检总局本着政务公开的原则，在网站上发布了“在日本SK-Ⅱ品牌的多项化妆品中，查出禁用成分铬和钕”的消息。因为SK-II的知名度，这个消息在各大媒体都登上了醒目位置，宝洁中国遭遇有史以来最为严重的信誉危机。随着SK-II风波的进展，李佳怡的名字也为大家所熟知。
在公司危机的时候，李佳怡表现出了对企业员工强大的凝聚力和领导力。在员工大会上，李佳怡说：“如果你们相信的话，那么就有勇气同舟共济，来面对公司这样一个艰难时刻，而你们永远不会孤独。”因为她的出色表现，宝洁公司的员工一直保持着对公司的信心。
但是，会说中文并不等于了解中国，了解中国消费者的心理。质检总局的报告引发了全国性的退货潮，消费者希望实施“召回”，即无条件退货。但是由于宝洁公司担心无条件退货可能意味着承认产品有质量问题，并且担心假冒产品浑水摸鱼，设置了苛刻的退货条件。被这些条件和因为忙碌而难免出错的宝洁员工激怒的消费者数不胜数，甚至有了《致宝洁大中华区总裁李佳怡女士及SK-II高管的公开信》在网络上的广泛传播。
SK-II事件除了在品牌形象上挖了墙脚之外，还导致了宝洁中国的巨额损失。按照每个SK-II专柜每月的销售额约为40万至50万元计算，事件之前，SK-Ⅱ在中国内地的97个专柜一年的销售额约为5.2亿元，每天的销售额约为145万元。危机历时80多天，宝洁公司因停售就已经损失了1.16亿元的销售额。而退货造成的直接和间接损失，包括公关费用，业内人士估计超过10亿元。
霉运当头，因为SK-II在宝洁中国战略和零售商谈判中至关重要的地位，李佳怡开始在公关方面大力投入。2006年11月18日，宝洁以4.2亿元蝉联央视标王，总广告额比去年多了2600万元。在不到三个月的时间，宝洁的捐赠额达497万元，大大超出宝洁2005年全年捐赠总额547万元。2006年，李佳怡荣获“广州市荣誉市民”称号。
在危机的80多天里，李佳怡专程飞赴北京做政府公关，和质检总局、卫生部交涉。12月3日，SK-Ⅱ在广州重开时，甚至请到了广州市副市长出席，为恢复上市做一个权威的注脚。
